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上海逸峰生物科技有限公司

基因表達分析新技術(三)

時間:2011-11-14閱讀:644
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科學家們?yōu)榱四苌钊肓私馓禺愋曰虮磉_,發(fā)展了許多實驗技術,比如芯片技術,PCR,高通量測序等,但是要想得到的結果,仍然依賴于實驗操作人員對于技術掌握的熟練程度。而且隨著基因表達研究越來越多,為了確保公布的結果的性,對于相關分析也越來越嚴格。不過所幸目前也有了更多基因表達分析相關的產品,這些產品帶來的新技術也許能幫助我們解決難題。

計數(shù)表達
 

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“過去所有用于分析基因表達的方法都是相對間接的方法——通過轉錄標記,和芯片雜交檢測表達水平”,來自Illumina國內公司的資深科學家Gary Schroth說,“目前發(fā)展趨勢很清楚,世界正朝著測序,或者說是計數(shù)分析發(fā)展”,RNA測序也更多的計數(shù)分析,直接分析生物樣品中的分子特征。
2007年1月,Schroth研究組研發(fā)了一種稱為RNA-seq的實驗方法,這種方法能完成cDNA全長的測序。在短短幾年間,這種技術已經應用于多篇發(fā)表文章中,正如Schroth自己所說的,“現(xiàn)在,有超過300份同行評審發(fā)表文章采用了RNA-seq方法”,他也提及了增長的高通量——從2007年的每次完成4000-6000萬發(fā)展到了今天Illumina HiSeq 2000系統(tǒng)的3億。讀長也翻了三倍,而且如今研究采用的也大多是雙末端測序方法。同時一些上市的試劑盒也促進了RNA測序的發(fā)展,比如Illumina2010年底推出的TruSeq RNA Sample Prep Kits,這一試劑盒能從總RNA生成文庫,并與Illumina測序產量兼容。與之前的方法相比,預混液試劑排除了大部分移液步驟,并減少了純化次數(shù),讓手工操作時間降至zui低。全新的自動化友好的流程形式能夠平行處理zui多96個樣品。通過目前新一代測序平臺上zui易用的樣品制備流程,這實現(xiàn)了經濟、高通量的RNA測序。

來源:生物通

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